трудно сказать, общее количество порядка 50000 файлов, сейчас таких 12, причем синхронизация полностью останавливается, он постоянно грузит эти файлы, если их удалить, то найдутся следующие такие же, причем нет системы, это могут быть фото, видео, pdf, excel, word, как текущие, которые недавно были созданы/изменялись, так и такие, которые никто не трогал с 15-16 года.
Думаю яндекс что-то меняет на своей стороне и cloudsync думает, что там не актуальный файл, видимо придется переходить на другой сервис. Яндекс однозначно меняет у файла дату создания, т.е. файл загруженный сегодня на яндекс